战列巡洋舰和航空母舰作为无尽的拉格朗日中的顶级舰种，其模块系统直接决定了舰船的战略定位与实战效能。战巡模块主要分为武器系统、防御系统和辅助系统三类，武器模块包含轨道炮、离子炮等重型火力单元，可针对不同目标类型调整攻击模式；防御模块通过护甲强化或能量护盾提升生存能力，部分战巡还能通过策略技能改变站位；辅助模块则提供维修、资源回收等特殊功能。这些模块的组合使战巡能灵活承担前排抗伤、中排输出等战术角色。
航母模块的核心在于舰载机搭载系统的差异化设计。基础模块通常提供5-8个舰载机位，分为大型战机、中型战机和护航艇三种类型。大型战机模块侧重对舰火力投射，中型战机强化防空与绝育能力，护航艇模块则增强持续作战效能。部分特殊模块能提升舰载机15%伤害或命中率，但受限于特定机型适配。与战巡不同，航母模块更强调对空域控制能力的精细化调整，通过子系统搭配形成制空权优势。
战巡与航母共有的装甲模块存在显著差异。战巡装甲普遍配备90-240点基础护甲值，部分型号可激活能量护盾减免25%能量伤害；航母装甲则侧重闪避属性，低结构值时能触发机动规避策略提升生存率。战巡的乌拉诺斯之矛级通过物理防御模块可实现240点伤害抵抗，而太阳鲸航母则依赖护盾系统维持战场存续。这种差异反映出重型舰船与航空母舰在防御理念上的根本分歧。
武器模块的战术价值体现在射程与伤害类型的组合上。战巡主炮系统如伽马风暴离子炮具有1200点基础伤害，优先攻击大型目标；航母的8联装反舰导弹则采用220点单发伤害的多轮打击模式。部分武器系统附带士气鼓舞策略，在击毁敌舰后能大幅缩短冷却时间。这些设计使得顶级舰船在持续作战中能保持火力压制，但需要合理规划技术点分配以发挥最大效能。
技术强化系统是模块功能的核心支撑。每艘舰船拥有5-7个可改装子系统，通过蓝图技术值解锁强化选项。战巡通常优先加点主武器伤害与冷却缩减，航母则侧重舰载机返回速度与命中提升。模块间的协同效应显著，例如综合损管系统与防御模块搭配可形成攻防一体的战斗体系。玩家需根据舰队构成和战术需求进行模块组合，而非简单追求单项数值最大化。
模块系统的动态调整机制赋予舰船战术弹性。游戏中所有模块均可随战场形势更换，面对防守态势时可临时加装防御模块，突击作战时则切换为攻击型配置。这种设计要求玩家深入理解各模块的触发条件和作用机理，通过预判战场变化提前规划模块组合。部分稀有模块需要通过特定协议或活动获取，其性能优势往往体现在特殊场景的适应性上。
